Las prestaciones ofrecidas por el Servicio de Biología Molecular se pueden clasificar en dos grandes bloques: Genómica/Transcriptómica y Metabolómica/Proteómica.
Entre las principales prestaciones de la parte de Genómica y Transcriptómica destacan:
- Secuenciación masiva de genomas completos con capacidad de producción de 360 Gb totales por ensayo.
- RNA-Seq: en experimentos de transcriptoma codificante es posible secuenciar 48 muestras juntas con una profundidad de 25 millones de lecturas/muestra.
- RNA-Seq en experimentos célula única (single cell sequencing) con una capacidad de secuenciación de 20.000 lecturas/célula para 4.000 células. Incluye la generación de las librerías scRNA-Seq.
- Metagenómica tipo Shotgun y del 16S.
- Análisis de expresión a nivel de genes (transcriptomas), de exones, investigación de procesos de splicing y estudios de microARN mediante microarrays de ADN
- Secuenciación tipo Sanger y análisis de fragmentos de ADN: genotipado basado en el estudio de microsatélites o en la identificación de mutaciones puntuales (single nucleotide polymorphism genotyping, SNP), análisis del polimorfismo de fragmentos amplificados de restricción, etc.
- Estudios de expresión génica, discriminación alélica (SNP), detección de secuencias de ácidos nucleicos específicas y de interés (ensayos Plus/Minus) y High Resolution Melting mediante PCR a tiempo real.
- Autentificación de líneas celulares mediante DNA Barcoding.
- Autentificación de líneas celulares humanas mediante análisis de microsatélites o marcadores STR (Short Tandem Repeats).
- Análisis mediante huella genética.
- Sistema bioanalizador para determinar la cantidad, calidad y tamaño de ADN, ARN y proteínas.
En el ámbito de Metabolómica y Proteómica podemos citar:
- Electroforesis de proteínas (tanto a nivel de separación por isoelectroenfoque como por tamaño e incluso la combinación de ambos procedimientos).
- Electrotransferencia de proteínas a membrana.
- Identificación de proteínas de interés, tanto a partir de muestras líquidas como desde bandas o fragmentos de gel de electroforesis.
- Identificación de mutaciones de secuencia en proteínas de interés.
- Determinación de peso molecular exacto de proteínas nativas en disolución mediante HPLC-HRMS.
- Determinación de masa exacta de compuestos de bajo peso molecular mediante HPLC-HRMS.
- Análisis de metabolitos y otros compuestos (lípidos, hormonas, tóxicos, fármacos,…) mediante HPLC-HRMS, con posibilidad de cuantificación absoluto y/o relativa.
Adicionalmente, el Servicio de Biología Molecular cuenta con un diverso equipamiento que da soporte a otras técnicas bioquímicas generales, como, por ejemplo:
- Análisis molecular mediante espectroscopía de absorbancia, fluorescencia y dicroísmo circular.
- Análisis de tamaño de partícula mediante dispersión dinámica de luz láser (DLS).
- Análisis de muestras mediante difracción de rayos X de ángulo pequeño y grande.
- Análisis de muestras líquidas mediante microcalorimetría de alta sensibilidad (DSC e ITC).
- Separación y análisis mediante ultracentrifugación preparativa y/o analítica.
- Microdisección por láser.
El equipamiento disponible en el Servicio de Biología Molecular para dar soporte a este amplio conjunto de prestaciones puede consultarse aquí.
