Área Científica y Técnica de Investigación

Fondos Feder

E-CON-2020-28/SU/AM "Adquisición de una Plataforma de microcalorimetría de alta resolución y sensibilidad, en 2 lotes."

E-CON-2020-29/SU/AM "Renovación de una consola de radiofrecuencia para Resonancia Magnética de 400 MHZ"

E-CON-2020-30/SU/AM "Adquisición de una embarcación científica/técnica polivalente para la investigación del medio acuático costero y su entorno."

Preguntas realizadas en la plataforma y sus respuestas:

* Pregunta 1: Buenas tardes,una de las condiciones que exigen es que el casco sea en fibra ¿Se puede ofertar el casco y la embarcación en aluminio?

  Respuesta : En el momento de realizar el proyecto se valoró distintas posibilidades de construcción del casco de la embarcacción, siendo el resultado más acertado, la construcción en fibra, dadas  las caracteristicas de nuestro trabajo cotidiano, los equipos, la maquinaria que se han de instalar en la embarcación y las características de nuestro litoral y del Mar Menor. No se admitirán variaciones a este respecto.

 

* Pregunta 2: Buenos días, en relación a este expediente nos gustaría nos respondieran a las siguientes cuestiones:

1º) Con respecto a la petición de “Electrónica: Sonda/GPS, sonda 3D, emisora de radio con llamada selectiva digital (DSC)”, ¿pueden darnos más detalles técnicos sobre esta sonda/ GPS, Sonda 3D?.

¿Se refieren a una sonda de navegación, una sonda científica o una sonda para batimetrías?. En caso de que el objetivo sea la realización de batimetrías, sería necesario saber si se necesita una sonda Monohaz de una frecuencia, Sonda Monohaz de 2 frecuencias o sonda Multihaz.

2º) ¿Es necesario algún otro equipo científico?. Por ejemplo una sonda multiparamétrica, Sonar de Barrido Lateral, Perfilador de subsuelo, Correntómetro Doppler, etc.?

 Respuesta: Es una sonda de navegación; con traductor normal y traductor de 3D (ambas posibilidades).

 

E-CON-2020-31/SU/AM " Suministro de sistema nanocapilar de cromatografía líquida para espectrometría de masas."

E-CON-2020-33/SU/AM "Adquisición de una Plataforma de Análisis Metabólico en células vivas"

E-CON-2020-34/SU/AM "Equipo de microtomografía para investigación científica, diagnóstico por imagen y obtención de modelos 3D."

Preguntas realizadas en la plataforma y sus respuestas:

*Pregunta 1. Detector rápido y muy sensible "Flat Panel", capaz de resolver la hemodinámica del corazón del ratón o la actividad pulmonar sin   el uso de un agente de contraste.

Queremos confirmar aquí que el principal objetivo científico es resolver la hemodinámica del corazón del ratón o la actividad pulmonar sin el uso de un agente de contraste. Nuestro razonamiento detrás de esta pregunta es que esto se puede lograr tanto mediante la tecnología “Flat Panel” como con la Tecnología “CCD”, que podremos demostrar fácilmente.

Respuesta: Sí, el principal objetivo científico es resolver la hemodinámica del corazón del ratón o la actividad pulmonar sin el uso de un agente de contraste. Por tanto se consideraran lo equipos con tecnología CCD, siempre que se demuestre que cumple el objetivo.

 

*Pregunta 2 Alta resolución: resolución espacial 3D inferior a 10 µm en In Vivo Imaging.

Entendemos en esta especificación que lo que se está buscando es la resolución espacial 3D real y no un tamaño de píxeles absoluto que es el resultado del método post procesado de corte de píxeles.

Para demostrar la máxima resolución espacial real podemos proporcionar un escaneado usando un “phantom” de resolución en un protocolo de adquisición in vivo con una dosis limitada de rayos X de menos de 500mGy y así verificar la mejor resolución espacial que el equipo ofrece. ¿Podría confirmar que esto es lo que quiere que suministremos para demostrarlo?

Asimismo, mejorar esta resolución espacial descrita, está valorada en el apartado L sobre “Mejoras” para los Criterios de Adjudicación del Pliego de Licitación, que entenderíamos sigue el mismo criterio.

Respuesta: Sí, nos referimos a resolución espacial 3D real y no un tamaño de píxeles absoluto, resultado del método post procesado de corte de píxeles.

Sí, la mejora descrita en el apartado L, sigue el mismo criterio.

 

*Pregunta 3. Sistema de monitorización fisiológica integrado con sensor respiratorio, ECG, estabilización de temperatura y detección de movimiento corporal, proporcionando microtomografía 4D cardíaca y sincronización respiratoria resuelta a través de la sincronización prospectiva o retrospectiva para la toma de datos según ciclos respiratorios y cardíacos.

Con esta pregunta queremos asegurarnos que el Sistema de Monitorización Fisiológica Integrado en el equipo, es esencial. Hay sistemas de monitorización externos y no integrados más baratos disponibles, y de difícil sincronización con la toma de imágenes, pero no queremos comprometer la calidad del “gating” y ofrecemos un sistema de totalmente integrado y con sincronización absoluta para microtomografía 4D.

Respuesta: Se consideraran sistemas de Monitorización Fisiológica Externos, siempre que no comprometer la calidad del “gating y  demuestren que la sincronización es absoluta para microtomografia 4D.

E-CON-2020-37/SU/AM "Suministro e instalación de un Biomódulo con sistemas de seguridad y sostenibilidad, para investigaciones en Biomedicina y Acuicultura."

E-CON-2020-38-"Adquisición de un Microscopio de barrido láser confocal espectral con platina monitorizada, láser blanco o similar y módulo para medir FRET-FLIM"

E-CON-2020-58-"Adquisición de un Microscopio WideField con TIRF y super-resolución"

Preguntas realizadas en la plataforma y sus respuestas:

*Pregunta 1. En referencia al pliego de prescripciones técnicas

1) Para la descripción técnica que se cita a continuación (Página 2) PPT:

- Rueda de filtros externa con filtros de paso banda que permita seleccionar específicamente cada una de las 8 bandas de emisión descritas para todos los bloques de filtros.

¿Por qué motivo la rueda de filtros tiene que ser externa?

Respuesta:La especificación se refiere a una rueda de filtros externa a la torreta que permita seleccionar una sola de las bandas de emisión de los bloques de filtros para evitar el cruce entre canales.

 

-¿Sería aceptable como válida cualquier otra opción que cumpla con la función principal de filtrar la luz de emisión?

Respuesta:No sería aceptables la utilización de bloques de filtros individuales como sistema equivalente por suponer una pérdida de velocidad importante.

 

-Respecto al número de posiciones de dicha rueda de filtros, al ser dicha especificación de 8 posiciones exclusiva de un único fabricante, ¿se aceptaría como válida una equivalente de 7 posiciones?

Respuesta: Las especificaciones técnicas no exigen una rueda de 8 posiciones, solo se pide la posibilidad de seleccionar cada una de las 8 bandas de emisión en combinación con el bloque de filtros.

Las 8 posiciones en una rueda de filtros NO es exclusiva ya que existen varios fabricantes que ofrecen ruedas de 8 y más posiciones.

En relación a la última banda de detección (Cy5 o Cy7) al no existir Crosstalk no es necesario un filtro de emisión adicional.

 

2) Para la descripción técnica que se cita a continuación (Página 2):

2 Puertos de imagen motorizados a ambos lados del estativo, con reparto de luz 100% y rutas ópticas necesarias para adquisiciones de imagen de fluorescencia, TIRF, súper-resolución y campo claro.

¿Por qué motivo los puertos de imagen deben estar situados a ambos lados del estativo? Como bien es sabido, este tipo de configuración es exclusivo de algunos fabricantes, es por ello que ¿sería aceptable como válida cualquier otra posición (no lateral) siempre y cuando cumpla con la función principal de ser una salida de captura de imagen?

Respuesta:

Este requerimiento técnico NO es exclusivo, al menos 3 de los 4 grandes fabricantes montan dos puertos de cámara a ambos lados del estativo. Se suele montar así por ser la posición más cercana al objetivo, lo que se traduce en menor pérdida de luz.

No obstante, si los puertos son motorizados, idénticos y con reparto del 100% de la luz serán aceptados, aunque no estén a ambos lados.

 

3) Para la descripción técnica que se cita a continuación (Página 3):

1.2. Fuente de Iluminación para la excitación de fluorescencia tipo LED conectada por fibra óptica:

 Control de intensidad de iluminación.

 8 LED independientes con rango de excitación entre 390 y 740 nm.

 Tiempo de conmutación inferior a 1 ms entre LED.

 Sin mantenimiento.

 ¿sería aceptable como válidas fuentes de iluminación con un número máximo de 6 LEDs independientes y con rango espectral ligeramente menor?

Respuesta: No, los requerimientos mínimos son de 8 LEDs.

 

- En referencia a los criterios de adjudicación detallados en páginas de la 29 a la 30 del PA Cuadro de Características:

1) Para la mejora que se cita a continuación:

3. Mejora del sistema de deconvolución mediante la eliminación de la señal fuera de foco en tiempo real (ISO 2382-10:1979), durante la adquisición de imagen y sin necesidad de múltiples exposiciones o stacks. (3 puntos si lo permite, 0 si no lo permite).

¿El término “deconvolución” en dicho contexto se refiere a deconvolución 2D o 3D? Si se refiere a 3D, dicha mejora es exclusiva de un solo fabricante ¿Sería aceptable como válida (y por tanto puntuable) cualquier sistema de deconvolución 3D ultrarápido y que sin tener designación ISO 2382-10:1979 no prescinde en ningún momento de calidad de mejora de imagen?

Respuesta: En el PPT se solicita un sistema de deconvolución en 2D y en 3D. En el caso de la mejora de la página 29-30 PA se da la opción de ofertar un sistema adicional que mejore la señal en tiempo real sin stacks.

Una deconvolución 3D ultra-rápida es lo que se ha solicitado como requisito mínimo en la página 4 del PPT con procesado en GPU (tarjeta gráfica para mayor velocidad).

 

2) Para la mejora que se cita a continuación:

Objetivos adicionales que permitan usar distintos tipos de muestras (con otros índices de refracción, uso de muestras gruesas etc) (1 punto por objetivo suministrado, 0 si no se suministra ningún objetivo, hasta 2 puntos)

- 20x /0.4 LWD (1 punto)

- 20x /0.75 y multi-inmersión (W-Gly-oil) (1 punto)

Para el objetivo 20x/0.75 y multi-inmersión que es exclusivo de solo dos fabricantes ¿Sería aceptable como válido (y por tanto puntuable) incluir un objetivo equivalente de distinta magnificación (Ej: 30x multi-inmersión)? De forma opcional, ¿sería aceptable como válido (y por tanto puntuable) incluir dos objetivos 20x uno de agua y otro de aceite para este de multi-inmersión?

Respuesta: Este objetivo se ha solicitado para trabajar con muestras gruesas con índice de refracción ajustable. Cualquier opción que aplicativamente permita trabajar en las mismas condiciones solicitadas será valorada consecuentemente.

 

*Pregunta 2.

1) Para la descripción técnica que se cita a continuación (pág. 4 del PPT):

-2. Módulo TIRF:

Módulo para TIRF y microscopía de superresolución completamente motorizado.

Sistema de alineamiento automático.

Posibilidad de realizar HiLo.

Al menos dos objetivos compatibles para TIRF.

Posibilidad para la adquisición simultánea de imagen en dos bandas cromáticas distintas.

Cuatro láseres compatibles para realizar TIRF.

Ajuste automático en adquisición secuencial de la penetración de la onda evanescente

para cada láser.

Para la característica “Sistema de alineamiento automático” ¿A qué se refiere exactamente?

Respuesta: El sistema de alineamiento automático hace referencia al posicionamiento del láser en el back focal plane (BFP) del objetivo para obtener la imagen TIRF. 

 

-¿Qué componentes tienen que estar motorizados para dicho alineamiento? ¿Sería aceptable cualquier otro sistema donde exista un reposicionamiento automático de la platina XY para la medida TIRF?

Respuesta: Es necesario que esté motorizado el escáner que posiciona el láser en el BFP y normalmente suele estar automatizado el enfoque del láser en dicho BFP. Se aceptaría cualquier otra configuración convenientemente justificada de alineamiento automático.

La platina XY no suele estar implicada en los alineamientos del TIRF.

 

- Para la característica “Ajuste automático en adquisición secuencial de la penetración de la onda evanescente para cada láser” ¿A qué se refiere exactamente? ¿Podrían dar más detalles más específicos sobre esta característica?

Respuesta: Esta especificación hace referencia a que se garantice la misma profundidad de penetración al cambiar de láser, que se suele conseguir mediante movimiento predictivo de la posición del láser en el BFP.

 

- ¿Sería aceptable cualquier otro sistema (aunque no mida directamente la penetración de la onda evanescente) donde el ángulo TIRF es controlable?

Respuesta: Sí, sería aceptable cualquier otro sistema que garantice la misma profundidad de penetración al cambiar de láser.

 

Para la descripción técnica que se cita a continuación (pág. 4 del PPT):

3. Sistemas de super-resolución.

Sistema de detección basado en deconvolución con las siguientes características:

- Deconvolución tanto de stacks 3D como de imágenes de plano único (2D), aplicable durante la adquisición de imagen en cualquier modo de trabajo, con procesado en tarjeta gráfica para mayor velocidad.

- Al menos un sistema adicional de super-resolución basado en deconvolución asistida por hardware o microscopía de super-resolución estocástica.

En la descripción “Al menos un sistema adicional de super-resolución basado en deconvolución asistida por hardware o microscopía de super-resolución estocástica” entendemos que si el sistema de super resolución ofertado es un sistema estocástico, no es necesario ningún tipo de deconvolución ya que estas técnicas no usan este tipo de tratamientos matemáticos ¿podrían confírmanoslo?

Respuesta: La especificación de la página 4 del PPT indica que es un requisito mínimo la deconvolución en 2D y 3D.

Además, se indica que se requiere un sistema adicional de super-resolución. Esto es un sistema adicional que no elimina ninguno de los requisitos mínimos. El sistema de super resolución estocástica aplicativamente no tiene relación con la deconvolución.

 

*Pregunta 3.

En referencia al sistema de asignación de puntos:

1) Para la mejora que se cita a continuación (pág. 29-30 del PCAP):

2. Suministro de sistema de super-resolución estocástico. Se valorará hasta 8 puntos la propuesta que suministre este módulo completo, el resto de las ofertas se valorarán mediante la fórmula PTn = Sumatorio PCi:

Se tendrá en cuenta:

- Al mayor número de láseres compatibles. Se valorará con 2 puntos la propuesta con mayor nº de láseres, puntuándose el resto con arreglo a la siguiente fórmula:

Pa = Poa x Oav/Opmax.

(Puntuación = 2 x aumento del nº de láseres de la oferta que se valora/Propuesta con mayor nº de láseres compatibles.

- Sistema adicional para asegurar que la potencia de los láseres es adecuada para super-resolución estocástica mediante lente afocal insertable que concentra el láser en el centro del campo o láseres de alta potencia específicos para estocástica (2 punto si se suministra, 0 si no se suministra).

- Suministro de objetivo específico para super-resolución estocástica: 160x o equivalente (2 puntos si se suministra y 0 si no se suministra).

- Posibilidad de realizar técnica STORM y PALM (2 puntos si es posible y 0 si no lo es).

En referencia a la característica “sistema adicional para asegurar que la potencia de los láseres es adecuada para la super-resolución estocástica mediante lente afocal insertable que concentra el láser en el centro del campo o lásers de alta potencia específicos para estocástica” Al tratarse de una especificación exclusiva de un único fabricante, se acepta como válido válido (y por tanto puntuable) cualquier sistema que permite asegurar la potencia de los láseres independientemente de la tecnología que utiliza?

Respuesta: En el apartado hace referencia a un “sistema adicional con lente afocal insertable” que NO es exclusivo un solo fabricante. Además, se está indicando que es válido tanto este sistema como la oferta de los láseres directamente de alta potencia para las técnicas de super-resolución estocástica. Se aceptarán otros sistemas debidamente justificados y que aseguren la potencia requerida.

 

*Pregunta 4.

2) Para la mejora que se cita a continuación (pág. 30 del PCAP):

• Mejoras del módulo TIRF (hasta 8 puntos)

- Alineamiento automático mediante sensor que mide la reflexión determinando empíricamente el ángulo en el que se produce la reflexión total (2 puntos si se da la posibilidad, 0 puntos si no).

- Sistema que incluya colimador para mantener el enfoque del láser en el BFP del objetivo (2 puntos si lo incluye, 0 puntos si no)

- Sistema de iluminación con corrección de objetivo de TIRF con campo útil 19 mm en cámara (2 puntos si lo incluye, 0 puntos si no)

- Cámara de alineamiento que se inserta en el condensador permitiendo la visualización segura del haz de láser para la calibración inicial de los bloques de filtros y objetivos (1 punto si lo incluye, 0 puntos si no).

- Posibilidad de ampliación del equipo con escáner para fotomanipulación (1 punto si lo incluye, 0 puntos si no).

En referencia a la característica “Alineamiento automático mediante sensor que mide la reflexión determinando empíricamente el ángulo en el que se produce la reflexión total” Al tratarse de una especificación exclusiva de un único fabricante, se acepta como válida (y por tanto puntuable) cualquier otra tecnología que consiga lo mismo?

Respuesta: Esta mejora NO es exclusiva de un solo fabricante. Se valorará una tecnología similar debidamente justificada que asegure el mismo fin.

 

-En referencia a la característica “Sistema que incluya colimador para mantener el enfoque del láser en el BFP del objetivo” Al tratarse de una especificación exclusiva de un único fabricante, se acepta como válida (y por tanto puntuable) cualquier otra tecnología que consiga lo mismo (ej: lente de Bertrand en frente de la cámara)?

Respuesta: Se aceptaría si la lente de Bertrand es parte de un sistema de ajuste automático del enfoque del láser. 

 

-En referencia a la característica “Cámara de alineamiento que se inserta en el condensador permitiendo la visualización segura del haz de láser para la calibración inicial de los bloques de filtros y objetivos” Al tratarse de una especificación exclusiva de un único fabricante, se acepta como válida (y por tanto puntuable) cualquier otra tecnología que consiga lo mismo?

Respuesta: Se valorará cualquier otra tecnología que permita hacer esta calibración sin proyectar el láser fuera del microscopio (usualmente en el techo, con el peligro que esto conlleva para usuarios y personal técnico). Tenemos conocimiento de que este sistema ha sido ofertado por al menos dos compañías diferentes.

3) Para la mejora que se cita a continuación (pág. 31 del PCAP):

Velocidad máxima en la adquisición de imágenes (hasta 5 puntos)

Se valorará la velocidad máxima en la adquisición de imágenes del equipo con 10 ms de exposición para los siguientes experimentos modelo: (La asignación de puntuación se realizará mediante la aplicación de la fórmula matemática resultante de otorgar la puntuación máxima 5 puntos a la oferta con menor tiempo de realización de los experimentos modelo, y la puntuación mínima 0 puntos a la oferta que obtenga el mayor tiempo para la realización de los experimentos modelo. A las ofertas comprendidas dentro de dicho intervalo se le asignará un valor proporcional a la baja efectuada, aplicando para ello la siguiente fórmula P= 5 x (L-O)/(L-M)

Como es bien sabido, la velocidad máxima de una adquisición depende de muchos parámetros y no todas las compañías utilizan las mismas condiciones, siendo por tanto complicado (y casi imposible) tener datos en base a los modelos que aquí indican y que se tratan de un solo fabricante. ¿los datos solicitados se refieren a fluorescencia de campo ancho o a super resolución?  En caso de que sea fluorescencia de campo ancho ¿a qué canales? ¿pueden ser canales que están en un mismo cubo multi-banda?

Respuesta: 

Las condiciones de los experimentos están detalladas en la página 30 del PA.

Exposición: 10ms/posición y canal.

Placa 96 pocillos: 1 posición por pocillo con tres canales de fluorescencia diferentes.

Placa 96 pocillos: 5 posiciones por pocillo con tres canales de fluorescencia diferentes.

Se han elegido dos experimentos modelo reproducibles por cualquiera para poder hacer una comparativa entre las posibles ofertas, como bien indicas no sería posible hacerlo de otro modo.

Los datos de velocidad requeridos pueden ser adquiridos por cualquier método de los solicitados, campo ancho o super resolución.

En el caso de usar fluorescencia de campo ancho se recomienda que lo hagan en las condiciones que más le favorezcan, por ello no se han dado más especificaciones.