El ADN mitocondrial, como el nuclear, también posee una cierta tasa de mutación, acotada temporalmente. Al ser el ADN mitocondrial una especie de "unión invisible" entre cada madre y sus hijos (varones o hembras) ello significa que se pueden analizar los ADN mitocondriales de individuos y poblaciones. Los idénticos o más similares tendrán una antepasada ancestral más próxima y en los más dispares la antepasada será más lejana. Ello permite realizar interesantes estudios antropológicos, de seguimientos de migraciones y de búsqueda de árboles genealógicos y evolutivos.